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El uso de técnicas microbiológicas independientes del cultivo ha confirmado, sin embargo, que el árbol broncopulmonar aloja una gran cantidad de microorganismos, conocido como el microbioma, compuesto por bacterias, virus y hongos. Solo un 1% de este conjunto crece en cultivo.</p><p id="par0010" class="elsevierStylePara elsevierViewall">El análisis de la composición bacteriana independiente del cultivo se ha basado hasta ahora en el gen que codifica el ARN ribosómico (16S rRNA). El ribosoma es esencial para la transcripción del ARN mensajero y, en las bacterias, el gen 16S rRNA se ha mantenido inalterado a lo largo de los siglos, ya que cualquier mutación limita su viabilidad. El análisis del gen 16S rRNA permite así la clasificación taxonómica de cada estirpe bacteriana y su secuenciación es utilizada para describir la composición de las bacterias presentes en un ecosistema<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0080"><span class="elsevierStyleSup">1</span></a>. Las bases de datos de referencia del gen 16S rRNA permiten clasificar las secuencias en una muestra desde los niveles taxonómicos más altos (filo) hasta los inferiores (género), aunque en ocasiones se pueden mostrar insuficientes para alcanzar el nivel de especie. La identificación bacteriana se aborda utilizando el término de «unidad taxonómica funcional» (<span class="elsevierStyleItalic">operational taxonomic unit</span> [OTU]) y considerando como tal cada unidad taxonómica similar a la referencia. Así, una OTU se estimará como equivalente a género si su coincidencia con la referencia alcanza un 94%, o a especie, cuando llega al 97%. La composición del microbioma se expresa habitualmente como abundancia relativa, entendiendo como tal la proporción de copias del gen 16S rRNA que corresponden a cada OTU identificada. La limitación más importante del uso del análisis del gen 16S rRNA es la imposibilidad de obtener información de virus y hongos por esta vía.</p><p id="par0015" class="elsevierStylePara elsevierViewall">El sujeto normal aloja una flora microbiana filogenéticamente diversa en el árbol broncopulmonar<a class="elsevierStyleCrossRefs" href="#bib0085"><span class="elsevierStyleSup">2,3</span></a>, con firmicutes, bacteroidetes y proteobacteria como sus filos más frecuentes, y una frecuencia baja de OTU correspondientes a microorganismos potencialmente patógenos como los del género <span class="elsevierStyleItalic">Hemophilus</span><a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0095"><span class="elsevierStyleSup">4</span></a>. Estudios recientes con muestreo de orofaringe y lavado broncoalveolar por procedimientos distintos, dirigidos a imposibilitar la contaminación cruzada de las muestras, y realizados en el mismo día, han confirmado la similitud entre el microbioma de la orofaringe y el árbol broncopulmonar en el sujeto sano, paralelismo que se ha atribuido a la aspiración de secreciones durante el sueño<a class="elsevierStyleCrossRefs" href="#bib0100"><span class="elsevierStyleSup">5,6</span></a>.</p><p id="par0020" class="elsevierStylePara elsevierViewall">La información sobre el efecto del humo de tabaco sobre el microbioma respiratorio en el sujeto sano es escasa. Estudios iniciales en muestras orofaríngeas han observado disbiosis, entendiendo como tal la presencia de uno o más géneros con abundancia relativa claramente elevada<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0110"><span class="elsevierStyleSup">7</span></a>. Los estudios de la flora respiratoria no han hallado diferencias entre fumadores y sujetos que nunca han fumado, sin embargo<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0115"><span class="elsevierStyleSup">8</span></a>, lo que indica que la respuesta a los componentes del humo del tabaco es más marcada en la flora orofaríngea que en la broncopulmonar.</p><p id="par0025" class="elsevierStylePara elsevierViewall">La colonización bronquial por microorganismos potencialmente patógenos ha sido bien establecida por cultivo en la EPOC, y la aparición de los síntomas respiratorios en la exacerbación se ha relacionado principalmente con la incorporación de nuevas cepas a esta flora. Los estudios que han examinado el microbioma broncopulmonar en pacientes con EPOC estable han observado diferencias claras respecto a la flora propia del sujeto sano<a class="elsevierStyleCrossRefs" href="#bib0085"><span class="elsevierStyleSup">2,9</span></a>. Proteobacteria, bacteroidetes, acinetobacteria y firmicutes son más comunes en la EPOC, con <span class="elsevierStyleItalic">Pseudomonas, Streptococcus, Prevotella</span> y <span class="elsevierStyleItalic">Haemophilus</span> como géneros frecuentes en estos pacientes. Esta predominancia se ha obtenido tanto en muestras de mucosa bronquial como en lavado broncoalveolar o cepillo protegido, muestras que se han mostrado como equivalentes<a class="elsevierStyleCrossRefs" href="#bib0100"><span class="elsevierStyleSup">5,10</span></a>. Resultados similares se han obtenido en esputo, aunque esta muestra aborda una región diferente del aparato respiratorio y aloja una comunidad microbiana diferenciada<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0125"><span class="elsevierStyleSup">10</span></a>.</p><p id="par0030" class="elsevierStylePara elsevierViewall">El estudio del microbioma en secreciones respiratorias durante la exacerbación identifica géneros que aumentan en su abundancia relativa, así como la flora colonizadora, que no se modifica<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0130"><span class="elsevierStyleSup">11</span></a>. En una fracción de los episodios este incremento en la abundancia de la bacteria causal no es identificado por el cultivo, que únicamente recupera microorganismos sin cambios en su abundancia relativa respecto a las muestras obtenidas en estabilidad, aunque estos sean potencialmente patógenos, como <span class="elsevierStyleItalic">Pseudomonas aeruginosa</span>. Así, el examen del microbioma respiratorio confirma que en una parte de las exacerbaciones el aumento en un patógeno bacteriano pasa desapercibido para la microbiología convencional, por sus limitaciones de sensibilidad, mientras que el cultivo identifica microorganismos que en realidad son únicamente colonizantes, lo que da una información equívoca para el clínico. Estos cambios en la composición bacteriana del microbioma respiratorio durante la exacerbación se ven favorecidos por las infecciones virales, ya que en las semanas inmediatas a un resfriado común la abundancia relativa de proteobacteria aumenta<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0135"><span class="elsevierStyleSup">12</span></a>. El tratamiento antibiótico de la exacerbación de la EPOC reduce la abundancia de proteobacteria, aunque la terapia exclusivamente con corticoesteroides favorece la sobrerrepresentación de taxones específicos que incluyen géneros del filo proteobacteria<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0140"><span class="elsevierStyleSup">13</span></a>.</p><p id="par0035" class="elsevierStylePara elsevierViewall">La reciente caracterización del microbioma respiratorio en la fibrosis pulmonar idiopática ha objetivado una sobrerrepresentación de microorganismos de los géneros <span class="elsevierStyleItalic">Streptococcus, Staphylococcus</span> y <span class="elsevierStyleItalic">Prevotella</span><a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0145"><span class="elsevierStyleSup">14</span></a>. La presencia de disbiosis con predominancia de microorganismos de los filos proteobacterias o firmicutes en muestras de lavado broncoalveolar se asocia a respuesta inflamatoria, mientras que la sobrerrepresentación de bacteroidetes se asocia a remodelación<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0150"><span class="elsevierStyleSup">15</span></a>, lo que puede tener trascendencia en las enfermedades del parénquima pulmonar.</p><p id="par0040" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Aunque se empieza a conocer la composición microbiana de la flora respiratoria en las enfermedades respiratorias crónicas, la implicación del microbioma en su patogenia, especialmente en lo que hace a sus componentes considerados como no patógenos por la microbiología basada en el cultivo, es prácticamente desconocida. La pérdida de diversidad bacteriana, frecuentemente relacionada con un aumento en la abundancia relativa de proteobacteria, se asocia a una mayor gravedad en la mayoría de las enfermedades respiratorias crónicas, y es muy posible que este cambio en la composición del microbioma sea uno de los factores que influye en la su progresión, como ya ha sido demostrado en la fibrosis pulmonar idiopática<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0145"><span class="elsevierStyleSup">14</span></a>. El análisis del ARN bacteriano y la metagenómica, técnicas de reciente implementación, serán capaces de proporcionar información funcional del microbioma respiratorio, de detallar interacciones entre virus, hongos y bacterias, y, potencialmente, de facilitar el diseño de estudios de intervención dirigidos a conservar la flora microbiana que actúa como mutualista y facilita la funcionalidad del sistema respiratorio frente a los patógenos respiratorios que la sustituyen progresivamente cuando se desarrolla EPOC o fibrosis pulmonar idiopática.</p></span>" "pdfFichero" => "main.pdf" "tienePdf" => true "bibliografia" => array:2 [ "titulo" => "Bibliografía" "seccion" => array:1 [ 0 => array:2 [ "identificador" => "bibs0005" "bibliografiaReferencia" => array:15 [ 0 => array:3 [ "identificador" => "bib0080" "etiqueta" => "1" "referencia" => array:1 [ 0 => array:2 [ "contribucion" => array:1 [ 0 => array:2 [ "titulo" => "Towards a natural system of organisms: Proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya" "autores" => array:1 [ 0 => array:2 [ "etal" => false "autores" => array:3 [ 0 => "C.R. 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2024 November | 26 | 7 | 33 |
2024 October | 223 | 32 | 255 |
2024 September | 228 | 35 | 263 |
2024 August | 209 | 54 | 263 |
2024 July | 134 | 28 | 162 |
2024 June | 218 | 46 | 264 |
2024 May | 205 | 44 | 249 |
2024 April | 130 | 37 | 167 |
2024 March | 159 | 29 | 188 |
2024 February | 86 | 40 | 126 |
2023 October | 3 | 2 | 5 |
2023 September | 4 | 0 | 4 |
2023 April | 1 | 1 | 2 |
2023 March | 74 | 13 | 87 |
2023 February | 308 | 50 | 358 |
2023 January | 239 | 40 | 279 |
2022 December | 199 | 55 | 254 |
2022 November | 328 | 49 | 377 |
2022 October | 384 | 64 | 448 |
2022 September | 379 | 54 | 433 |
2022 August | 295 | 69 | 364 |
2022 July | 190 | 59 | 249 |
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2022 May | 365 | 95 | 460 |
2022 April | 289 | 63 | 352 |
2022 March | 409 | 80 | 489 |
2022 February | 288 | 118 | 406 |
2022 January | 256 | 89 | 345 |
2021 December | 208 | 63 | 271 |
2021 November | 326 | 144 | 470 |
2021 October | 380 | 119 | 499 |
2021 September | 344 | 88 | 432 |
2021 August | 325 | 105 | 430 |
2021 July | 241 | 78 | 319 |
2021 June | 248 | 97 | 345 |
2021 May | 318 | 95 | 413 |
2021 April | 825 | 194 | 1019 |
2021 March | 433 | 80 | 513 |
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2021 January | 333 | 62 | 395 |
2020 December | 252 | 43 | 295 |
2020 November | 377 | 70 | 447 |
2020 October | 431 | 61 | 492 |
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2020 August | 283 | 45 | 328 |
2020 July | 306 | 63 | 369 |
2020 June | 269 | 45 | 314 |
2020 May | 408 | 58 | 466 |
2020 April | 548 | 53 | 601 |
2020 March | 479 | 68 | 547 |
2020 February | 419 | 50 | 469 |
2020 January | 313 | 80 | 393 |
2019 December | 233 | 43 | 276 |
2019 November | 313 | 42 | 355 |
2019 October | 349 | 62 | 411 |
2019 September | 393 | 63 | 456 |
2019 August | 262 | 92 | 354 |
2019 July | 176 | 44 | 220 |
2019 June | 168 | 31 | 199 |
2019 May | 261 | 26 | 287 |
2019 April | 432 | 82 | 514 |
2019 March | 174 | 63 | 237 |
2019 February | 143 | 59 | 202 |
2019 January | 115 | 33 | 148 |
2018 December | 144 | 54 | 198 |
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2017 December | 82 | 31 | 113 |
2017 November | 8 | 6 | 14 |
2017 October | 7 | 2 | 9 |
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